Theo quy định của pháp luật, các cơ sở sản xuất, kinh doanh thực phẩm đều phải xin cấp giấy chứng nhận vệ sinh an toàn thực phẩm (trừ những cơ sở sản xuất ban đầu nhỏ lẻ, cơ sở kinh doanh thực phẩm nhỏ lẻ, cơ sở kinh doanh thực phẩm bao gói sẵn không yêu cầu điều kiện bảo quản đặc biệt theo quy định và những người bán hàng rong)
1.Bộ Y tế cấp
Bộ Y Tế cấp giấy đăng ký vệ sinh an toàn thực phẩm cho các loại hình sản xuất kinh doanh sau:
Cửa hàng bán thực phẩm chín, nhà hàng, khách sạn, cơ sở chế biến thức ăn sẵn, cửa hàng ăn, căng tin, bếp ăn tập thể, khu du lịch, cơ sở kinh doanh nước khoáng thiên nhiên, nước uống đóng chai, cơ sở sản xuất, kinh doanh bao bì, dụng cụ tiếp xúc trực tiếp với thực phẩm thuộc phạm vi ngành y tế, cơ sở sản xuất, kinh doanh thực phẩm chức năng, thực phẩm tăng cường vi chất dinh dưỡng, phụ gia thực phẩm, chất hỗ trợ chế biến thực phẩm
2.Bộ Nông nghiệp cấp
Bộ Nông Nghiệp cấp giấy phép đăng ký vệ sinh an toàn thực phẩm cho các loại hình sản xuất kinh doanh sau:
Ngũ cốc; thịt và các sản phẩm từ thịt; thủy sản và sản phẩm thủy sản; rau, củ, quả và sản phẩm từ rau, củ, quả; trứng và các sản phẩm từ trứng; sữa tươi nguyên liệu; mật ong và các sản phẩm từ mật ong; thực phẩm biến đổi gen; muối; gia vị; đường; chè; cà phê; cacao; hạt tiêu; điều và các nông sản thực phẩm; dụng cụ, vật liệu bao gói, chứa đựng thực phẩm thuộc lĩnh vực được phân công quản lý.
3.Bộ Công thương cấp
Bộ Công Thương cấp giấy phép đăng ký vệ sinh an toàn thực phẩm cho các loại hình sản xuất kinh doanh sau:
Siêu thị, lễ hội, chợ, hội chợ, tạp hoá, các cơ sở sản xuất bánh kẹo, rượu, bia, nước giải khát, sữa chế biến, dầu thực vật, sản phẩm chế phẩm tinh bột, bánh, mứt, kẹo, bao bì chứa đựng, bao bì chứa dựng thực phẩm thuộc phạm vi quản lý của Bộ Công Thương